Тут очень много нюансов и тонкостей.
К примеру, если Вы собираетесь строить дом для себя, то есть для одной семьи, причём строение будет не выше трёх этажей, то нужен минимальный набор документов.
Это свидетельство на владение землёй (то есть документ подтверждающий Ваше право на землю, на которой будет возводиться дом),
Далее градостроительный план (данный план в местной администрации выдаётся, или городской, или районной) участка и схема будущего дома, то есть надо чётко в плане указать где именно будет строиться дом на участке, его размеры и так далее.
Ну а дальше можно приступать к строительству.
Узаконивать (Вы об этом спрашиваете), можно и после строительства дома, но не советую, очень много шансов, что строение не узаконят.
Есть определённые требования и пожарников и Санэпидстанции, есть строительные нормы и правила, всё это нельзя нарушать.
Нужен план-проект.
И последнее, если дом строится для проживания нескольких семей, то такое упрощённое оформления разрешения к нему не относится.
При получении градостроительного плана, надо всего лишь написать заявление и приложить к нему копию документа о собственности на участок, всё остальное сделает администрация, срок 30-ь дней и даже платить ни чего не надо.
"Бегать" по всем инстанциям (газ, свет, вода, канализация и так далее), Вам не надо.
Узаконивать после строительства себе дороже.
Ограничений по количеству штрафов нет, строение без разрешительных документов считается не законным, штрафовать могут в день по 10-ь раз (это к примеру) на всей стадии строительства.