Моё мнение, важно что та самая труба (фановая) есть в наличие, то есть лучше что она вообще есть.
А всё остальное абсолютно индивидуально.
Если вывести фановую трубу вот таким образом
вдоль стены (фасад), то с эстетической точки зрения лучше через крышу, фановая труба вдоль стены не украшает строение.
И не важно какая это труба (пластик, чугун).
Тем более речь о деревянном доме, очень часто фасад вообще ни чем не отделывается (я имею ввиду штукатурку, сайдинг и.т.п), просто производится конопатка и всё на этом.
Но есть и плюсы, не нужно демонтировать кровельное покрытие, не нужно проходить перекрытие, труба крепится на кронштейнах к стене, работа менее трудоёмкая и затратная.
И плюс, такой вариант вывода фановой трубы займёт гораздо меньше времени, можно сделать и самостоятельно без приглашения специалистов.
Если дом уже построен (вместе с крышей, естественно) то удобней выводит через фасад, не нарушая целостность и перекрытия и кровли, правда нужно учитывать какой именно кровельный материал использовался, в некоторых случаях через крышу лучше не выводит, это крайне затратный вариант.
Если дом на стадии строительства, то моё мнение, фановую трубу лучше выводить через крышу.
Вообще канализация обустраивается на стадии строительства дома, а не после, поэтому определиться не сложно.
Дом построен, канализация не обустроена, выводим фановую трубу через фасад, ведётся строительство, выводим через крышу.
Трубы лучше брать, раструбные.