Я так понял речь идёт об унитазе с вертикальным сливом (именно так это называется), а второй вариант это косой выпуск и горизонтальный.![][1]
Тут нет понятия "лучше".
Лучше как покажет канализация, которую не переделывают под унитазы.
Унитаз покупается под вывод канализации.
В квартирах это чаще всего "косая" горловина (с косым выходом).
С вертикальным выходом в пол, канализация должна быть в полу, в квартирах этот вариант практически не возможен (разве что на первом этаже, да и то много проблем).
Вывод:
Осмотрите выход трубы канализации, после этого принимайте решение, косой выход горловины чаше всего, лучший вариант, унитаз можно сдвинуть близко к стене сэкономив на пространстве помещения.
Прямой выход тоже возможен и в этом случае, но через гофру, гофра сдвинет унитаз к двери.
По остальным показателям унитазы примерно равны, вертикальный выпуск совсем не означает что слив лучше, там просто конструкция унитазного сифона иная (см. фото, выше).