Вы совершенно правы, крепление фанеры просто необходимо дублировать, то есть клей+дюбеля с шурупами.
Ваш мастер пытается сэкономить не только деньги, но и время. Дело в том что клей в зависимости от основы, сохнет от пары суток до недели.
Пока клей сохнет по фанере нельзя ходить.
Лучшим в этой области считаются клеи на водной основе (водно-дисперсионные) к примеру вот не плохой клей "UZIN MK 61" (Уцин)
на него можно приклеить как паркет так и фанеру к стяжке.
Но обязательно необходимо продублировать дюбелями.
Клей сохнет в сравнении с "коллегами" не так долго, до 5-и суток.
Резкого запаха нет ( в отличии от клея на основе растворителей).
Ну и ещё к огромному плюсу можно отнести не покупку грунтовки.
Этот же клей просто разведите водой, сделайте чуть жиже и им грунтуйте, грунтовать лучше в два слоя, грунтовку можно наносить валиком, так быстрее.
Ну и конечно необходимо лист фанеры разрезать на несколько равных частей (целые листы лучше не крепить).
Не забывайте о зазорах между листами фанеры, фанера "дышит" ( то есть расширяется и проседает), между стеной и фанерой так же оставьте шов, примерно в сантиметр.
Куски нарезанной фанеры укладывайте в разбежку.
Всё это (необходим комплекс работ) предотвратит в дальнейшем скрип паркета о котором Вы спрашиваете.