По экологичности примерно одинаковые.
Но видов ламината и линолеума довольно много, то есть сравнивать лучше конкретный ламинат и конкретный линолеум.
Оба половых покрытия это "химия" то есть используются не натуральные материалы, но и та самая "химия", может быть безвредна для человека.
И линолеум и ламинат если они сертифицированы, могут использоваться даже в детских учреждениях, то есть все гигиенические и экологические требования соблюдены.
Ламинат это многослойный материал,
основа ДВП повышенной плотности, ДСП и.т.д, есть виниловый ламинат.
Линолеум по своей структуре, тоже многослойный материал
(хотя есть и однослойный).
При изготовлении и ДВП и ДСП используют в качестве связующего фенолформальдегидные смолы, говорить о некой экологичности (абсолютной) тут не приходится, материал не натуральный.
Тоже самое и линолеум, наиболее распространённый и доступный по цене это линолеум ПВХ, ПВХ поливинилхлорид (полимер) то есть тоже материал не натуральный.
Есть конечно натуральный линолеум, но купить его практически не возможно, такое половое покрытие находится в верхнем ценовом сегменте, да и многие составляющие заменены современной "химией".
Лет сто назад такой линолеум изготавливался только из натуральных материалов, древесная смола, льняное масло, известь, мука из пробки, натуральные красители.
По этой технологии такой линолеум сейчас почти не выпускают, все натуральные составляющие заменены более дешёвыми синтетическими.
Вывод:
Подбирать половое покрытие отталкиваясь только от экологичности этих 2-х материалов, вообще не правильно, учитывать надо иные характеристики (прочность, долговечность, эстетическая составляющая, влагостойкость, способность выдерживать большие нагрузки длительное время и.т.п.).
Если нужна именно экологичность, то покупается иное половое покрытие, половая доска, паркет, мрамор, гранит и.т.д.