Я бы посоветовал в начале разобраться с причиной протекания полов в подвале.
Их много и плохая наружная гидроизоляция и грунтовые воды и проблемы с отмосткой и так далее.
После этого можно уже решать проблему.
Вот не плохой вариант гидроизоляционная смесь Ceresit CR 65 (Церезит),
это морозостойкая ,паропроницаемая смесь на основе цемента.
Применяется и на полах в подвалах в том числе.
Основание должно быть ровным, если есть проблемы, то ремонтируем трещины, сколы, просушка.
Убираем пыль.
Смесь наносится в два слоя.
Первый слой более жидкий, в принципе можно наносить и шпателем, но советую первый слой кистью.
Поверхность увлажняем, но без фанатизма (без луж).
Первый слой наносим в одном направлении.
Просушка, но не полная (тут всё зависит от температуры и влажности в помещении).
Второй слой разводим уже более густую смесь (замешивать лучше венчиком).
Второй слой наносится уже шпателем и перпендикулярно первому слою.
Уделяем внимание стыкам полы-стена, можно чуть зайти на стены.
Просушка (примерно, неделя, это полная просушка) и дальше уже всё что хотите, начиная от стяжки.
Два слоя это минимум.