Я так понял речь о скважине на воде.
Теоретически за два года чего-то особо страшного произойти не должно, но есть целый ряд индивидуальных моментов.
Скважины разные, практически у каждой скважины есть предел (дебит) на откачку воды, если скважина эксплуатировалась правильно, тот самый дебит не превышался, то худшее что может произойти это заливание (иногда после ремонта скважину можно продолжать эксплуатировать, иногда без вариантов), или вообще всё будет в порядке.
Вообще специалисты советуют постоянно пользоваться скважиной, даже если это скважина на даче и зимой ей не пользуются, надо хотя раз в месяц сливать пару кубов воды, иначе могут возникнуть проблемы и с насосным оборудованием и с тем самым заиливанием.
Ну а в целом работу возобновить она сможет, но срок эксплуатации может сократиться и значительно (из-за заиливания).
Ну и конечно перед эксплуатацией после простоя, скважину лучше прокачать, очистить, смотрите по месту, если на выходе вот такая мутная жижа
вместо воды, то какая тут эксплуатация, такую воду даже для технических целей лучше не использовать.