По Вашему вопросу можно предположить, что бревна сруба лежат на мхе. Если это так, то это хороший вариант использования природного материала в качестве утеплителя. Мох издавна применялся при рубке срубов.
Для конопатки мох малоподходящий материал. У него три минуса: весьма затруднительно конопатить, его невозможно основательно забить в пазы, тем более – в углы сруба, птички легко вытаскивают мох для строительства гнезд.
В качестве утеплителя советую использовать паклю льняную (крапивную) или джутовую. Кстати, последняя разновидность пакли основательно потеснила традиционные – паклю из льняных волокон, крапивы и конопли. Тому много причин. Но речь сейчас не об этом.
Любая пакля годится для конопатки. Покупать лучше рулонную паклю, а не в виде шнура. Как правило, пазы разные, поэтому с диаметром шнура трудно определиться. Рулонная пакля наиболее практичная.
Вы берете часть пакли ( около 1 или 2 метров) втыкаете её, потом подбиваете конопаткой, а затем из неё же скручиваете валик и плотно его забиваете. Легко можно регулировать объем пакли, толщину валика.
Для работы я всегда использовал деревянную конопатку. Делал её из березовой дощечки или лиственницы. Конечно, если там, где вы живете, есть дуб, то его древесина - отличный материал для конопатки.