Какую вы хотите трубу выложить, напрямую, или с колодцами? Если напрямую, то для кладки используйте раствор глины и песка в пропорциях 1х3. В месте примыкания к деревянным конструкциям проложите листы асбеста. Трубу можно для надежности оштукатурить тем же раствором, но с добавлением одной части цемента. Если планируете выложить трубу с колодцами, то вот схема.
Но я бы посоветовал обратиться к печнику. Уж очень накладно всё исправлять, если тяги не будет.