Точечный ремонт возможен, но водоэмульсионную краску необходимо снять.
Если получится удалите краску точечно, если нет, то удаляйте всплошную.
Мы не знаем какая именно водоэмульсионная у Вас краска, но в любом случае нельзя на менее прочное основание (краска) наносить более прочное (шпаклёвка).
Краска просто отойдёт вместе со шпаклёвкой, причём в ближайшее время.
В подготовку должно войти следующее:
Снятие краски.
Расшивка трещины.
Грунтовка с просушкой.
В общем-то всё, можно приступать к ремонту, вот не плохая гипсовая шпаклёвка "Перфекта" (Perfekta),
это универсальная шпаклёвка.
Если нет желания покупать целый мешок (точнее нет необходимости) шпаклёвки продаются и на развес, но следите что бы шпаклёвка была из вскрытого мешка.
В принципе и ПВА с гипсом подойдёт, смотрите уже сами.
По окончании ремонтных работ, просушка, шлифовка, грунтовка и можно красить опять той же водоэмульсионной краской.