Как класть кафель за открытым стояком канализации, который находится близко к стене?

Лучше его закрыть коробом, но если нет и толщины (расстояние от стены до стояка) достаточно для плитки и клея под ней, то в первую очередь нужна качественная подготовка:

Насечку можно сделать при помощи молотка и зубила,

Вместо зубила можно использовать стамеску.

Остатки отслаивающейся краски (если поверхность окрашена) убираем шпателем.

Грунтовать поверхность удобно плоской (флейцевой) не большой кистью.

Просушка.

Облицовку кафелем лучше начинать с противоположной стороны от стояка, за стояком будет подрезка.

Кладка почти обычная, единственное что может не получится, это наносить плиточный клей гребешковым шпателем, клей наносим на каждую плитку индивидуально.

Пробить уровень в горизонте и вертикали не получится, уровень просто не поместится за стояком, поэтому и кладка от противоположной стены предыдущие ряды и есть "маяк".

Между плиток вставляем крестики.

Через сутки после кладки, вынимаем их, очищаем швы и затираем фугой, для этих работ особых препятствий, нет.

Облицовку второй стены лучше начинать со второго ряда, а не от ряда за стояком.