Оцинковка, по мне, так сильно хлипкая...
Под коньком собирается основная влага и вскорости данный элемент превратиться в труху, тем более, что дырявить его придётся саморезами и толщина стенок хлипкая.
Я, например, использовал бы для этих целей обычный металлический уголок на всю длину теплицы от торца до торца.
Нюанс...
Не стоит перекрывать кровлю одним сплошным листом, дабы избежать напряжения в поликарбонате через конёк.
Лучше каждый скат делать отдельно.
Я делал кровлю из стёкол и на зиму снимал. Да... Дороже... Но практичнее и на долгие годы.
Уголок конька покройте антикором.
На счёт проложить... можно наклеить на уголок полоски обычной резины по всей наружной длине.