Всё на Ваше усмотрение, можно вставить, можно не вставлять.
Если подходить к вопросу очень серьёзно, то жить в доме с треснувшим фундаментом опасно для жизни.
Проблемы с фундаментом могут привести к полному разрушению дома, причём это может произойти мгновенно, когда проблема станет критической.
Надо разбираться с фундаментом, ставить маяки, выяснять не растёт ли трещина, не разрушается ли фундамент.
Затем ремонт фундамента.
А вставлять, или не вставлять окна это такая несущественная мелочь о которой не правильно думать первоначально.
Можно воспользоваться технологией деревянного строительства и в проём установить окосячку (она же обсада)
данный конструктивный элемент как раз и создан для компенсации усадки.
Но окосячка не спасёт дом от разрушения, да и компенсировать очень большую усадку она не сможет.