Если Вы самостоятельно сделали входную дверь, то думаю, что с коробкой проблем не должно возникнуть. Наверное Вы её делали из расчёта на дверной проём? Иначе действительно могут возникнуть проблемы при установке.
Для начала следует приобрести готовые заготовки из досок желаемой толщины с уже выбранной четвертью. Выглядят они вот так:
Далее снимаем размеры с двери- высота и ширина.
Теперь приступаем к сборке. Вырезаем из досок нужные детали, то есть боковые части и порог. При помощи саморезов крепим друг к другу.
В готовую коробку помещаем дверь и при необходимости подгоняем.
Намечаем места крепления завесов и соединяем дверную коробку с дверью.
По своему опыту могу с уверенностью сказать, что лучше устанавливать дверь вместе с коробкой. Так Вы исключите возможные перекосы и в случае их обнаружения, оперативно их исправите путём подгонки коробки.