Выбор клея по дереву просто огромен, вот не плохой "Момент Столяр".
Клей наносится на сухую и чистую поверхность, возможно поверхность надо обезжирить.
Нанесли клей, чуть подождали, прижали.


Тут важно знать этот самый раскол по длине находится (опирается) на площадке под подоконником, или висит в воздухе.
Если опоры нет, то я бы посоветовал после склеивания и просушки и конечно установки подоконника, дополнительно под подоконник установить вот такие металлические уголки (с размером уголков, надо определяться по месту) ,
они снимут нагрузку (точнее возьмут на себя) с раскола.
Просто закручиваются саморезами по дереву в тело деревянного подоконника, в стену смотрите сами, если бетон, то разметка, отверстия, забиваем дюбель и закручиваем шуруп.
Ещё вариант вот такие деревянные дюбеля (шкант, чопик),
тут уже надо уметь работать рулеткой, разметка отверстие под дюбель в торце двух половинок, дюбель на тот же клеем (см. выше) и соединили две половинки (торцы подоконника так же промазываем клеем, шкант это дополнение).
Можно дополнительно к клею использовать вот такие пластины,
закручиваются с внутренней стороны подоконника, саморезы по дереву, пластину можно заглубить (нужна стамеска) в "тело" подоконника (если это необходимо).
Всё описанное, выше, говорит о том что если есть нагрузка на подоконник (к примеру стоят цветы в горшках, или люди на него (подоконник) опираются периодически, то никакой клей не выдержит, нужны дополнительные крепления (выбор вариантов, предоставлен).