Я так понял подпольем Вы называете погреб, или подвал, то есть помещение под полом.
На мой взгляд, без устранения причины чем либо обрабатывать подполье нет смысла.
Если в подполье постоянная высокая влажность, то это может привести к появлению грибка и плесени и иных микроорганизмов которые отрицательно воздействуют на ту самую картошку.
Определитесь с вентиляцией подполья, вентиляция может быть как естественной, так и принудительной, но в любом случае, она должна быть рабочей.
Далее, повышенная влажность может быть из-за высокого уровня грунтовых вод и недостаточной, или отсутствующей гидроизоляцией подполья.
Соответственно, вначале, занимаемся гидроизоляцией помещения (подполья).
Если пол в подполье у Вас земляной и в подполье грибок и плесень, то придется удалять верхний слой грунта, в ином случае плесень, грибок будет появляться повторно и даже после обработки помещения.
Если в помещении есть некие стеллажи, то дерево обрабатывается антисептиками, а если стеллажи металлические, то металл должен пройти стадию антикоррозийной обработки.
Из личного опыта добавлю, проветривание подполья регулярное, тоже не на последнем месте.
Перед обработкой подполья (после устранения причины вызывающей проблемы) выносим из помещения всё что там хранится, проветриваем и просушиваем помещение.
Далее вариантов масса.
Можно использовать специальную серную (дымовую) шашку
"затыкаем" вентиляцию, поджигаем шашку (шашка устанавливается на не горючее основание), покидаем помещение и оставляем в таком состоянии на несколько дней, то есть пару суток в помещение не заходим.
Учитывайте площадь помещения и читаем инструкцию к шашке.
Если шашка не вариант, то можно попробовать вещества содержащие в себе хлор, например "Белизна".
Разбавляем водой и обрабатываем этим раствором, стены, потолок подполья.
Так же можно использовать известь, медный купорос, или и известь и купорос работающие в паре.
Но в любом случае вначале производится зачистка помещения, обработка деревянных и металлических элементов, проветривание, сушка, проверка работоспособности вентиляции и только после этого проводится обработка.