Снимаете шифер и стелите профнастил. Практика показывает, что для профнастила необходимо что бы на крыше был сплошной настил из досок. А для шифера обычно делается обрешётка из бруска 50х50 мм. Поэтому если у вас обрешетка, её надо будет убирать, а вместо нее стелить доски. А уже поверх крепить профнастил.