Под скобель дороже и вот по какой причине:
Скобель это очень "старинный" инструмент плотников.
Обработка бревна ведётся в ручном режиме,
 ручной труд, практически всегда, дороже механизированного.
Оцилиндрованное бревно, это фрезерованное бревно, то есть его фрезеруют в условиях производства на специальных станках.
Станки разные, профиль бревна может быть разным.
Если отталкиваться только от цены, то картина выглядит как написал выше, но дело в том что древесина это не конкретно что-то одно.
Древесина может быть разной включая ценные породы древесины.
Цена всего строения в первую очередь зависит от этого, а не от способа обработки бревна.
Так же на цену влияют и стоимость работы мастеров.
Получается что цена складывается из огромного количества составляющих и однозначный ответ дать практически не возможно (точнее, ответ не может быть однозначным отталкиваясь только от "оцилинрованое", "скобель").