В первую очередь отличаются составом (основой).
Латексные краски (ну, или эмаль, как Вы пишите, хотя к "классической" эмали краски вообще не относятся), это эмали на воднодисперсионной основе.
А масляные краски (эмали), это краски в состав которых входят, пигменты, продукты переработки сырой нефти, масла и.т.п.
Чаще всего в случае с масляными эмалями (не краской) имеют в виду масляно-фталевую краску,
вот её в "народе" называют "масляной эмалью".
Отличаются экологичностью.
В латексных эмалях нет химических составляющих (даже тот самый латекс, основа, это природный материал), то есть она безвредна для человека.
Ей можно работать во внутренних жилых помещениях.
У латексных эмалей практически нет запаха, в отличии от масляных эмалей.
Латексные краски паро-проницаемые в отличии от масляных, латексная эмаль более эластичная.
Масляная эмаль не растворяется в оде, в отличии от латексной.
Работать (красить) с масляной краской сложней чем с латексной, она более густая по консистенции.
Масляная эмаль дольше сохнет.