Отвечая на все Ваши вопросы сразу же отмечу.
Ввод в эксплуатацию это сдача объекта специальной комиссии.
То есть последняя стадия, Вам дом надо в начале построить и лишь затем вводить  его в эксплуатацию.
Вы на стадии фундамента, пока беспокоиться не о чем, стройте, тем более дом деревянный, он усадку будет давать год и более, ни двери, ни окна не вставить (если конечно это не клеенный брус).
Вы получили множество разрешительных документов от различных служб (газовщики, электросети, водопровод и так далее), есть проект дома, все документы согласованы.
Вот они же и будут проверять что Вы построили согласно разрешительных документов.
Сам бланк (акт, разрешение) ввода дома в эксплуатацию
 выдадут только после получения технического паспорта на дом.
Ну а правила следующие:
В наличии должен быть построенный дом с дверьми, окнами и.т.д.
Стены под чистовую отделку, то есть заштукатурены как минимум  (саму отделку можно и позже сделать).
Полы, потолок,  на потолке и полах опять же можно черновую отделку (например стяжки на полах, без финишного покрытия).
Наличие системы отопления, освещение, водопровод и канализация, иначе БТИ будут считать это строение не жилым.
Вот это основные моменты.