Принципиальности в очередности снятия пленки и монтажа листов нет. Здесь все зависит от удобства снятия. Например на крутоскатной крыше сделать это будет довольно сложно.
Если вы делает монтаж аккуратно, и после этого по листу не предполагается ходить, делать какие то работы в непосредственной близости, то можно сначала снять пленку и после этого монтировать.
Коли же вы намереваетесь проводить еще какие то работы, совмещенные с воздействием на профлист пыли, грязи, то пленку лучше удалить по завершению этих работ. Так вы лучше сохраните целостность лакокрасочного покрытия и внешний вид не тронутыми.
Следующий момент это крепежный материал на который крепится профлист. Если крепить лист с пленкой на кровельные соморезы, то пленку потом довольно не просто вытянуть из под них ни оставив "хвостов" и обрывков под прижимными шайбами. В случае когда профлист крепится на заклепки (как например к профильной трубе на заборе) то тут попроще, закрепка при вытягивани практически перерубает пленку оставляя отверстие в ней, поэтому снимать пленку с такого забора можно без проблем и после демонтажа.
При снятии пленки уже после монтажа, со всей поверхности, могут возникнуть проблемы (даже не могут а обязательно возникнут) с вытаскиванием ее из под соседнего листа в месте перекрывания одного другим.
Подводя черту под изложенными соображениями, можно сказать что по большей части, пленку с профлиста/профнастила лучше снимать перед монтажом.