Вам нужно, в первую очередь, не средство от грибка на подоконниках, а система приточно-вытяжной вентиляции. Вы пытаетесь бороться со следствием, а нужно устранить причину. Потому что грибок и плесень появляются не только на деревянных подоконниках, но и в других местах, включая Ваши легкие. Просто пока Вы не видите других мест. Причину Вы сами назвали: после замены старых деревянных окон на металлопластковые стал появляться грибок. Вы поставили герметичные окна, перекрыв доступ и выход воздуха через микро щели окон. Значит, если естественную вентиляцию перекрыли, нужно делать принудительную. Вспомните, как запотевает полиэтиленовый пакет, если в нем хранится, например, хлеб. А еще вспомните, что в пакете хлеб плесневеет, а если кусок хлеба остался лежать без упаковки, то он просто превратится в сухарь, а не покроется плесенью. Плесень - тот же грибок. В Вашем доме плесень начинает разрушать все поверхности. Металлопластиковые окна превратили Ваш дом в закрытый полиэтиленовый пакет, в котором и разводится плесень.
А на счет средства - выше Вам правильно сказали. Еще можно Валтти Аквабейс от Тиккурила, или любой другой.