Я держу бойлер постоянно наполненным водой, бойлеру более 8-и лет, пользуюсь пару недель в году во время профилактических работ на водопроводной сети (отключают ГВС).
Лучше воду не сливать, если конечно речь идёт о "классическом" бойлере в котором ТЭН, или ТЭНы (есть накопительные бойлеры с двумя ТЭНами, один нагревает воду, другой поддерживает заданную температуру), а не о бойлере с сухим ТЭНом.
В бойлерах с сухим ТЭНом, греющий элемент не контактирует с водой, он помещён в специальную колбу, бойлер такого типа можно слить, ни чего страшного не случится.
Если с бойлера постоянно сливать воду и не пользоваться им длительное время, ТЭН придёт в негодность за короткое время, ТЭН находящийся в воде прослужит годы.
Но конечно воду в бойлере надо периодически менять на свежую, для этого хотя бы раз в 3-и месяца, сливайте застоявшуюся воду.
Перекройте коренной кран ГВС, откройте кран подачи воды на бойлер, ГВС на смесителе, вода возможно будет с резким запахом сероводорода, вот её надо слить и наполнить бойлер свежей водой.