Да, многие хозяйки стерилизуют банки в микроволновке теперь, хотя большие-то не поместятся, всё равно по старинке придётся на плите или в духовке.
Кто-то наливает немного воды в банки, помещая их в СВЧ, кто-то сухие ставит, но тогда крайне важно (!) рядом с банками ставить стакан, наполовину водой наполненный, иначе микроволновка может очень даже просто выйти из строя, ведь одни пустые банки - всё равно, что пустую микроволновку включать, это запрещено - энергию магнетрона должно что-то поглощать (пищевые продукты или вода).