Можно ли загерметизировать герметиком на MS основе компенсаторный патрубок с внешней стороны?

Основа герметика о котором Вы пишите, это MS-полимер.

Если проще, то это своего рода "гибрид" состоящий из силикона и полиуретана.

Отличаются такие материалы (и герметики том числе) повышенной устойчивостью к уф-излучению (Вам эта характеристика не важна, так как речь о внутреннем помещении).

Великолепная адгезия и к ПВХ в том числе (вот это важно), длительный срок эксплуатации, выдерживает перепады температур и.т.д.

То есть технически это сделать можно, наносить лучше на сухую и чистую поверхность, поверхность нужно обезжирить.

Но на мой взгляд, нет какого смысла в покупке не дешевого герметика, справится с поставленной задачей и обычный силиконовый герметик.

Всё остальное на Ваше усмотрение и под Вашу ответственность.

Компенсатор (компенсаторный патрубок) не нуждается ни в какой герметизации и тем более наружной.

Нет такой технологии.

Я бы искал причину, а не боролся с последствиями.

Причины следующие:

На раструбе патрубка (компенсатора) есть паз под уплотнительное кольцо.

Возможно канализационную трубу резали по размеру и не сняли фаску.

Уплотнительное кольцо "не встало" в паз в раструбе, то есть оно сдвинулось, отсюда и протечки.

Разбираем этот узел, меняем кольцо, или устанавливаем его правильно.

Тоже самое могло произойти с раструбом тройника в который вставляется компенсатор.

Проблемы с уплотнительным кольцом.

Далее, чтобы труба не проседала в компенсаторе, я обычно устанавливаю вот такой хомут

и саму трубу нужно жестко зафиксировать хомутами к стене (если это стояк, то есть вертикальная труба).

Далее, возможно использовали различные материалы, например компенсатор купили вот такой

(это полипропилен, многослойный материал, фитинг относится к так называемой "бесшумной канализации"), а трубы используются ПВХ (серая труба).

Даже если диаметр компенсатора соответствует диаметру трубы, всё равно могут быть проблемы.

Меняйте компенсационный патрубок, он доложен быть изготовлен из того же материал что и канализационная труба.

Нижний стык это видимо вот такой тройник

(раструбный с уплотнительным кольцом) компенсатор сажайте до упора (снизу), ну и проверьте уплотнительное кольцо.

Если все эти варианты (правильные) не подходят, то можете сверху нанести герметик, но все это называется "колхозить", никаких протечек при правильном монтаже просто не должно быть.