Скорее всего термин "бурение ям" появился, чтобы не путать со скважинами, которые бурят при инженерно-геологических изысканиях, гидрогеологических исследованиях. Расценки на бурение при изысканиях содержатся в СБЦ 1999 г. на инженерно-геологические и инженерно-экологические изыскания.
Вообще есть машины, именуемые ямобурами. Они бурят отверстия большого диаметра. Скважинами это назвать язык не поворачивается.