К минусам можно отнести следующее:
Пробковые полы это не просто дорого, а очень дорого (дороже паркета при работе на круг).
Пробковое покрытие не устойчиво к влаге, это проблема ведь речь о полах.
Мебель даже не очень тяжёлая продавит такое покрытие, восстановление не возможно, только замена плитки
(если плитка, а не рулонная пробка).
По таком покрытию нельзя ходить в обуви, особенно женской на каблуках (шпильки).
Кошки наверняка проявят интерес к пробке и будут покрытие использовать в качестве когдеточки, это беда, пробка придёт в негодность очень быстро.
Обработка пробкового покрытия защитными составами, может привести к очень сколькой поверхности.
Вот это основное, так же хотелось бы отметить, пробковые полы это покрытие не из бюджетных и человеку со средствами, все эти минуса абсолютно не интересны, они не критичны, пробку можно заменить частично, плюсов у этого материала больше чем минусов.