Как переклеить только потолок, не трогая стены (после затопления)?

Если до этого все работы и главное последовательность, были выполнены правильно, то потолочные обои и обои на стенах вообще никак не контактируют между собой.

Перед поклейкой обоев по периметру помещения клеится, к примеру на шпаклёвку, потолочный плинтус,

Раз обои на потолке уже намокли, снять их будет проще, снимаем обои.

Далее определитесь чем штукатурили, или шпаклевали потолок, если гипсовыми растворами и залили потолок по всей площади, то советую снять гипс до основы, если залили локально, можно снять штукатурку (шпаклёвку) локально.

Далее полная просушка потолка.

Если есть жёлтые пятна от протечек, это ржавчина от арматуры которой армируется плита перекрытия.

В этих местах также снимаем штукатурку до основы, арматуру можно обработать о ржавчины, покрасить, далее грунтовка с просушкой, шпаклёвка заподлицо с общей поверхностью.

Грунтовка потолка всплошную с просушкой.

Нарезаем обои по нужному размеру.

Отбиваем разметку на потолке

Промазываем обои клеем, далее сама поклейка, прикладываем лист к поверхности, разглаживаем выгоняя воздух и.т.п.

Затем следующий лист обоев, тут уделяем внимание стыкам.

Что касается сохранности стен, то тут всё зависит от аккуратности поклейки обоев на потолок, можно и плёнкой стены прикрыть (защитить), если штукатурку с потолка сбиваем полностью, помимо стен плёнка кладётся и на пол,

Если ремонт локальный, или предстоит только переклейка обоев, то защита стен плёнкой будет лишней.