Всё зависит от Ваших личностных предпочтений, от общего интерьера в помещениях и от того что Вы желаете видеть на финише.
Деревянный потолок это не помеха.
Потолок можно заштукатурить (если большие не ровности).
Потолок можно зашпаклевать.
Можно сделать потолок из гипсокартона, включая многоуровневые.
Можно натяжной потолок.
Вагонка ПВХ.
Вагонка деревянная.
Потолочные плитки и.т.д и.т.п.
То есть у деревянному потолку можно применить практически любые виды отделки, применяемые на потолках, включая обои.
Конечно есть свои нюансы и сложности, к примеру под штукатурку на потолок набивается дранка, это довольно объёмная и сложная работа как и сама штукатурка по дереву.
А если в целом, без привязки к интерьеру, я бы посоветовал остановиться на деревянной вагонки (евровагонка),
всё же дом деревянный и потолки из этого же материала, более чем уместны.
А выравнивание потолка произойдёт обрешёткой (каркасом) под вагонку.