Можно защитить отражающей теплоизоляцией, к примеру Пенофолом.
Есть пенофол с уже нанесенным на него клеевым слоем, это пенофол типа "С"
(клеится фольгой к помещению, к батареи, другими словами.
Но вся ситуация не совсем верная.
Дело в том что подоконники ПВХ покрываются специальным термозащитным слоем они без особых проблем выдержат температуру нагретого, от батареи, воздуха.
Плюс ко всему, не совсем верно блокировать поступление тёплого воздуха к стеклу окна, стёкла будут затевать, на окнах будет образовываться конденсат.
Конденсат это повышенная влажность в помещении, это грибок и это плесень.
Производители ПВХ подоконников прекрасно знают, что подоконник в подавляющем большинстве случаев находится над батареей и естественно это учитывают.
У батареи и труб отопительной системы, есть свой предел по температура, к примеру для полипропиленовых труб температура теплоносителя не должна превышать 95-и градусов.
Так же не забывайте что есть нормы и правила установки радиаторов.
От верхней части радиатора, до нижней кромки подоконника должно быть не менее 100-а мм.
Если у Вас меньше, советую задать вопросы сантехникам которые устанавливали Вам радиаторы.