Вопросов слишком много, теоретически на них можно ответить, но на практике может получится, что что-то пойдёт не так, как было задумано.
Для начала давайте разберёмся как сбить плитку с шифера.
Он (шифер) хоть и достаточно толстый, но очень хрупкий.
Если плитку клеили ещё в советские времена, тогда особо то и плиточного клея не было, да и грунтовки практически не использовали, скорее всего плитка приклеена на кляксы цементного раствора, а потом швы заливали этим же раствором.
Шифер не очень надёжный материал для плитки, хотя раньше просто выбора не было.
Молотком и зубилом сбивать точно не стоит, так как неудачный удар разобьёт шифер, поэтому делайте как и задумали - перфоратор с наклонной тонкой лопаткой.
Но нет вероятности, что вы не побьёте шифер!
Вообще я бы заменил шифер на гипсокартон или другой материал, так как шифер (как я уже говорил) не надёжный материал, да ещё и под керамогранит.
Теперь ко второму вопросу, плиткорез за такую стоимость, думаю не будет хорошим и керамогранит им будет тяжело резать, лучше уже болгаркой, тем более, если не надо рисунок подбирать и делать кучу разрезов, тогда смысла нет в покупке.
Если вы решили всё-таки на шифер класть плитку, я бы вам советовал для начала штукатурить шифер с металлической сеткой, которую прикрепить к шиферу насквозь.
Штукатурить цементной штукатуркой гидроизоляционной!
Во-первых у вас будет монолит, во-вторых вы скроете шифер, содержащий асбест.
Теперь о толщине клея, я бы посоветовал покупать шпатель под 5-ти миллиметровую толщину клея, керамогранит достаточно большой и тяжёлый, тут нужен слой побольше.
Кстати, не забудьте об осыпающихся швах, лучше всего их расширить и прочно заштукатурить, если за ними находится несущая стена, я бы советовал в стену установить дюбеля и намотать между ними вязальной проволоки (это вариант подешевле), а уже потом штукатурить, обязательно выбирайте гидроизоляционную цементную штукатурку!
А вот листы ГВЛ на шифер я бы не прикреплял, лучше всего штукатурить (по моему мнению) в вашем случае.