Причины следующие (если речь о цементной затирки):
У Вас швы между кафельной плитки узкие, фугу приобрели для широких швов, она более крупнозернистая, та самая зернистость и даёт пористость поверхности.
При покупке фуги надо обращать внимание на этот показатель (ширина шва) указано на таре.
Возможно не правильно развели затирку, в ней мало воды, сухая затирка даёт такой эффект (пористость).
Возможно не правильно затирали швы губкой, губку не достаточно смачивали в воде, сухая (или не достаточно влажная) губка повреждает шов.
В этом случае, если прошло много времени после затирки, фугу надо удалять со шва и работу переделывать.
Возможно при укладке использовали плитку с сильным водопоглощением, а швы перед фугованием не увлажнили.
Керамика "вытянула" влагу из фуги отсюда и проблема.
Возможно не достаточно качественно удалили плиточный клей, перед фугованием, клей дают ту самую пористость основания, если прямо на него наносить фугу.