Важно учитывать размеру той самой щели (дыры).
Заделать можно вот при помощи специальной "проходки" из нержавеющей стали,
плюс герметизация и крепление хомутом.
Учитывайте и диаметр трубы дымохода при покупке "проходки".
Можно просто использовать кровельный герметик, если щели не большие по размеру, на конце дымохода у трубы, нет высоких температур.
Более дешёвый вариант, заделка цементно-песчаным раствором, песок просеянный, пропорции 1:2, цемент лучше брать марки М-500-т, в раствор можно добавить асбест.
Бустилат-каучуковая лента, ещё один вариант (она самоклеящаяся).
Битумная мастика так же может использоваться для заделки щелей, лучше горячего нанесения.
В продаже есть специальные герметизирующие кровельные ленты, верхний слой алюминий, медь, нижний клеевой слой и битум.
Можно из рубероида вырезать "фартук" и посадить его на битумную мастику.
Проходка мастер-флеш, ещё один не плохой вариант.