Ваше желание получить ответ, не прибегая к платным услугам проектировщика, вполне объяснимо. Но предупреждаю: без экспертизы объекта качество консультации и ее точность будут соответствующими. Вы не назвали множества ключевых моментов: состав почвы и тип фундамента; общий ли фундамент у пристройки и у сруба; степень сухости пиломатериала каркаса; отапливался ли сруб в зимнее время.
Основная усадка дома происходит в первые два отопительных сезона. После этого швы сруба можно герметизировать и не опасаться деформации. Но если вы решили обойтись без герметика, а лишь ежегодно подконопачивать щели, то с каждой конопаткой венцы будут подниматься, а потом планомерно садиться. И чем больше венцов и швов соответственно, тем заметнее коэффициент поднятия и усадки.
Без этих сведений могу посоветовать одно: ставить пристройку автономно, то бишь на отдельных сваях и без силовой привязки к срубу. Но этот вариант имеет недостаток: крышу пристройки скорее всего придется делать односкатной, и она должна быть ниже.
Если же фундамент у сруба и пристройки общий, и крышу хотите сделать общую, то вертикали каркаса должны быть на 10-15 см короче высоты сруба, а недостающая их высота должна компенсироваться металлическими элементами с резьбой. Они так и называются - компенсаторы усадки.
Компенсатор можно подкручивать, чтобы удлинить или укоротить. Обычно это делается весной и осенью.
Небольшое отступление: шифер безнадежно устарел, так как по цене примерно равен металлопрофилю и металлочерепице, но тяжелый, хрупкий и не скатывает снег (приходится чистить).